软件工程研究所成立于1988年，是我国最早从事软件工程研究与实践的单位之一。始终坚持理论与实践相结合，以科研带教学，以应用促科研，以科研服务产业的基本方针。在系统软件和软件工程领域享有较高的声誉。主要研究方向有：1）系统软件（操作系统、编译技术）；2）安全可靠软件系统的研发方法和工具；3）基于模型的软件工程方法；4）软件质量工程与测试评估技术；5）群智与智能化软件工程：6）需求工程；7）软件工程方法与实践的实证研究。承担了国家重大项目，在TSE、ICSE、FSE等国际顶级期刊会议及《软件学报》等国内权威刊物发表高水平论文300余篇，荣获多篇ACM/IEEE杰出论文奖，相关成果获北京市科学技术进步一等奖、中国标准创新贡献奖一等奖等。

  软件工程研究所，作为基层教学组织，也称为“软件教研室”，承担学校/学院教学和人才培养任务。软件教研室（软件工程研究）长期坚持落实立德树人根本任务，以前沿科研滋养教学，在教学科研创新中成就教师发展。坚持以学生为中心、理论联系实际的育人理念，探索数智赋能教学，承担了数十项教改项目，获批国家级一流本科课程3门、国家级教学成果奖3项、省部级教学成果奖5项；入选北京市教学名师1人，教书育人先锋1人，高校计算机专业优秀教师奖励计划2人。负责2个教育部虚拟教研室建设。3本教材入选为国家级规划教材。校企合作研发在线教辅平台和数字资源，推广覆盖全国400余所高校，并支撑了全国大学生系统能力大赛。

  软件工程研究所30年来培养硕士生、博士生近千名。服务于行业，发挥智库作用。担任了教育部软件工程教指委委员、专业学位研究生教指委软件工程协作组组长、CCF软件工程专委、教育专委主任委员等。承担软件测评工作（具有对应测评资质），为中标软件等企业提供技术支持。